Wybór właściwego systemu ERP to zadanie trudne i wymagające odpowiedniego podejścia.  Nie można zapominać o tym, że decyzja o wdrożeniu systemu ERP wiąże się z dużymi inwestycjami.  Oprócz tego,wybrany zestaw aplikacji będzie służył w przedsiębiorstwie przez co najmniej  10 najbliższych lat.   Niezmiernie istotne jest aby opracować jasne i proste kryteria wyboru Zwykle firma tworzy specjalny zespół specjalistów którzy mają za zadanie rozpatrzyć propozycję dostawców oprogramowania ERP.

W trakcie sprawdzania ofert specjaliści muszą opierać się na konkretnych przesłankach.  W przeciwnym razie zamiast zimnego osądu zadecydować mogą emocje. Każde kryterium musi cechować się mierzalnością.  Pozwoli to później ocenić czy podjęta decyzja była właściwa i czy zespół dobrze wywiązał się z powierzonych obowiązków. Aby ocena ta mogła być pozytywna zespół specjalistów musi wybrać odpowiednią metodę pracy. Najczęściej wykorzystuje się metodę porównawczą.  Polega ona na zestawianiu poszczególnych systemów ERP ze sobą i  ocenianiu ich pod konkretnym kątem. Sprawdza sie który system ERP ma lepsze funkcjonalności, szerszy zakres, jest prostszy w obsłudze, sprawia mniejsze kłopoty w trakcie wdrożenia itd. Oczywiście, osoby które chcą posługiwać się tą metodą muszą posiadać wiedzę na temat ERP w przynajmniej podstawowym zakresie. Muszą znać sposób ich funkcjonowania, specyficzne wymagania i orientować się w innych kwestiach które mają znaczenie dla ERP. Tylko wtedy będzie można porównać różne systemu całkowicie na własną odpowiedzialność.